使用全基因组关联研究鉴定甘蓝型油菜中SNP位点和与四个重要 ... | 蔬菜好營養
2019年8月25日—菜籽油(低芥酸菜子,芸苔)是全世界重要的健康植物油,其营养和经济价值在很大程度上取决于其种子脂肪酸的组成。在这项研究中,基于从SLAF-seq(特定 ...
菜籽油(低芥酸菜子,芸苔)是全世界重要的健康植物油,其营养和经济价值在很大程度上取决于其种子脂肪酸的组成。在这项研究中,基于从SLAF-seq(特定基因座扩增片段测序)开发的201,187个SNP标记,对全基因组中的四个重要脂肪酸含量特征(芥酸,油酸,亚油酸和亚麻酸)进行了全基因组关联研究。在两个环境(JXAU和JXRIS)中对300个油菜近交系进行了研究。通过MLM模型分析,分别检测到148个与这些性状显着相关的SNP位点,同时在芥酸,油酸和亚油酸三个含量性状中分别在A08和C03染色体上检测到30个SNP基因座。此外,观察到108个非常有利的等位基因,它们用于增加油酸和亚油酸含量,同时也用于降低芥酸含量。通过基本的局部比对搜索工具(BLAST),在这些显着的SNP-性状关联周围以100 Kb的距离进行搜索,我们鉴定了20个与脂肪酸生物合成相关的功能候选基因的直系同源基因,包括已知的重要的脂肪酸生物合成基因。 BnaA.FAE1和BnaC。A08和C03染色体上的FAE1,以及其他参与脂肪酸生物合成途径的潜在候选基因,例如FAD2,LACS09,KCS17,CER4,TT16和ACBP5的直系同源基因。该研究为揭示甘蓝型油菜的遗传变异和脂肪酸组成的改善奠定了基础。还观察到同时降低芥酸含量。通过基本的局部比对搜索工具(BLAST),在这些显着的SNP-性状关联周围以100 Kb的距离进行搜索,我们鉴定了20个与脂肪酸生物合成相关的功能候选基因的直系同源基因,包括已知的重要的脂肪酸生物合成基因。 BnaA.FAE1和BnaC。A08和C03染色体上的FAE1,以及其他参与脂肪酸生物合成途径的潜在候选基因,例如FAD2,LACS09,KCS17,CER4,TT16和ACBP5的直系同源基因。该研究为揭示甘蓝型油菜的遗传变异和脂肪酸组成的改善奠定了基础。还观察到同时降低芥酸含量。通过基本的局部比对搜索工具(BLAST),在这些显着的SNP-性状关联周围以100 Kb的距离进行搜索,我们鉴定了20个与脂肪酸生物合成相关的功能候选基因的直系同源基因,包括已知的重要的脂肪酸生物合成基因。 BnaA.FAE1和BnaC。A08和C03染色体上的FAE1,以及其他参与脂肪酸生物合成途径的潜在候选基因,例如FAD2,LACS09,KCS17,CER4,T...CN101773187B | 蔬菜好營養
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